厦门港水深浪低，是我国南方的天然良港，港内实行24小时通航。厦门港的国内航线，除省内开往沿海各线外，还有向南开往汕头、广州、海南岛，向北开往大连、天津、青岛、烟台、南京、镇江、上海等的航线。

     厦门与香港之间每周有客轮往返，每周三下午5点从厦门开往香港，每周二下午2点从香港开往厦门。厦门和平码头和台湾金门水头码头之间有交通轮，航程40分钟左右，票价180元人民币，但只对台胞、台商等人群开放。